1932年， 石井四郎发明了滤水器，并取得国家专利。“帝国医疗株式社会”从陆军那里接受订货，大量生产石井式滤水器。为了推行这种滤水器，石井四郎曾在参谋本部进行宣传，让参谋集合起来，他用滤水器将参谋本部前的池水加以过滤，自己当场喝下，证明没有细菌。“据说石井四郎曾把自己的小便用的滤水器过滤成透明的清水，带到陆军参谋总部，让大家看着他喝光。”他用这种方法证明滤水器性能非常出色。

　　七三一部队迁到平房以后，由三部负责防疫给水的研究和生产滤水器，并多次进行防疫给水演习。在诺门罕战争中，731部队派出防疫给水班直接参加了战场上的防疫给水。

　　机构

　　1938年，七三一部队迁至平房以后，将第三部留在来了哈尔滨市南岗原七三一部队原址，第三部又称为防疫给水部第三部管辖滤水器制造厂和细菌瓷弹壳制造厂。其任务是领导实施关东军管内部队的防疫和供水，制造滤水器和“石井式”土陶细菌弹壳。它在平房镇设有细菌武器研究、生产场所，领导731部队的运输班。

　　第三部内设庶务课、第一课、第二课、第三课。第三课内设滤水班、给水版、烧成班、工作班。

　　人员

　　七三一部队第三部部长依次是今江一夫、江口丰洁、增田知贞。防疫给水部下设的庶务课，课长为田中秋市；第一课，课长为佐藤，任务是检索；第二课课长为河岛三德，任务是毒物检测；，第三课下设滤水班、给水班、烧成班和工作班。烧成班班长为铃木重夫，负责弹壳制造；工作班班长为小原定夫，负责滤水机生产。