1932年, 石井四郎发明了滤水器,并取得国家专利。“帝国医疗株式社会”从陆军那里接受订货,大量生产石井式滤水器。为了推行这种滤水器,石井四郎曾在参谋本部进行宣传,让参谋集合起来,他用滤水器将参谋本部前的池水加以过滤,自己当场喝下,证明没有细菌。“据说石井四郎曾把自己的小便用的滤水器过滤成透明的清水,带到陆军参谋总部,让大家看着他喝光。”他用这种方法证明滤水器性能非常出色。
七三一部队迁到平房以后,由三部负责防疫给水的研究和生产滤水器,并多次进行防疫给水演习。在诺门罕战争中,731部队派出防疫给水班直接参加了战场上的防疫给水。